Apple annonce larrivée de BLAST, une technologie développée conjointement par Apple et Genentech qui accélère radicalement les recherches de protéines et dADN menées par le personnel biomédical
Soit jusquà cinq fois plus rapidement que les systèmes Pentium 4 à 2 GHz
MARKHAM, Ontario, le 7 février 2002 Apple® a aujourdhui annoncé une percée en matière du logiciel BLAST qui accélère les recherches de protéines et dADN menées en biomédecine et dans la découverte de nouveaux médicaments. BLAST dApple/Genentech est jusquà cinq fois plus rapide que limplémentation standard de BLAST, le logiciel de bioinformatique populaire du National Center for Biotechnology Information (NCBI).
BLAST dApple/Genentech rehausse la précision et la vitesse du BLAST standard du NCBI, en fonction de paramètres de recherche tels que la longueur de concordance de nucléotides. Dans le cas de certaines recherches courantes, cette version accélérera de 500 % le fonctionnement dun Power Mac G4 bi-processeur à 1 GHz comparativement à celui dun système Pentium 4 à 2 GHz exploitant la version standard de BLAST.
Apple et Genentech ont radicalement rehaussé la performance dun outil important que les chercheurs biomédicaux utilisent quotidiennement, de dire le docteur David Botstein, professeur et directeur du département de génétique de Stanford University. Je suis impressionné et ravi de constater quun ordinateur aussi abordable et facile dutilisation pour les scientifiques que le Power Mac G4 est aussi, voire plus, rapide que la version standard de BLAST qui fonctionne sur des appareils beaucoup plus coûteux.
Nous sommes très heureux davoir collaboré avec Apple dans le cadre de ce projet et davoir réussi à rendre ces améliorations de performance plus facilement accessibles à la collectivité scientifique par lintermédiaire du NCBI et de lAdvanced Computation Group dApple, daffirmer le docteur Richard H. Scheller, premier vice-président chargé de la recherche pour Genentech. BLAST dApple/Genentech permettra aux chercheurs de faire un usage plus efficace des données génomiques dans le cadre de leurs recherches biomédicales fondamentales et de leurs activités de découverte de nouveaux médicaments.
Mis au point par lAdvanced Computation Group (ACG) dApple en collaboration avec Genentech, Inc. et le département de génétique de Stanford University, BLAST dApple/Genentech est une version grande capacité de BLAST qui tire profit daméliorations algorithmiques, dune gestion avancée de la mémoire et de la capacité du processeur PowerPC G4 dApple, agissant de concert avec Velocity Engine, pour effectuer de multiples opérations par cycle dhorloge.
Apple offre cette version avancée de BLAST dApple/Genentech sous la forme dun logiciel de source ouverte et travaille conjointement avec le NCBI pour faciliter lutilisation par la collectivité biomédicale du nouveau code dans le cadre dun développement continu. Le code utilisé par BLAST dApple/Genentech ainsi que des analyses de sa performance peuvent être téléchargés à ladresse http://developer.apple.com/hardware/ve/acgresearch.html.
Velocity Engine et Mac OS X : lultime plate-forme scientifique Le processeur PowerPC G4 muni de Velocity Engine, fonctionnant de pair avec la base UNIX de source ouverte de Mac OS X, constitue une plate-forme incroyablement productive pour la science computationnelle. La capacité de Velocity Engine de préanalyser des données et deffectuer plusieurs opérations en virgule flottante par cycle dhorloge lui permet danalyser facilement les quantités massives de données dans le cadre de projets génomiques et de séquenage de protéines et dADN. Le tout nouveau Power Mac G4 bi-processeur à 1 GHz, capable dune vitesse ahurissante de 15 gigaflops, concède aux scientifiques de la vie une solution clés en main puissante mais tout aussi conviviale. Grce à Mac OS X, qui allie la puissance dUNIX à la simplicité du Mac®, le Power Mac G4 permet aux scientiques de mener des analyses de données personnalisées et dutiliser des applications de productivité de série sur le même bureau, ce qui contribue à réduire les coûts et à rationaliser le déroulement des opérations.
Apple Computer, Inc. a lancé la révolution de lordinateur personnel dans les années 1970 avec le Apple II et a réinventé lordinateur personnel dans les années 1980 avec le Macintosh. La vocation dApple est doffrir les meilleurs produits dinformatique personnelle et le meilleur soutien Internet aux étudiants, aux éducateurs, aux concepteurs, aux scientifiques, aux ingénieurs, aux gens daffaires et aux consommateurs partout dans le monde.
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